More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2981 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2981  Type II secretory pathway, component PulD  100 
 
 		 394 aa  789    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281289  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3269  phage-related secreted protein  48 
 
 		 460 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3908  Type II secretory pathway, component PulD  45.7 
 
 		 448 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1698  type II/III secretion system protein  35.55 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2071  type II and III secretion system protein  35.92 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1457  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447998  normal  0.0646338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  30.14 
 
 		 752 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  29.35 
 
 		 794 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  30.59 
 
 		 681 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  29.2 
 
 		 797 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  22.86 
 
 		 696 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  27.38 
 
 		 711 aa  90.1  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  31.82 
 
 		 756 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  26.94 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  25.41 
 
 		 805 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  28.2 
 
 		 803 aa  80.9  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  24.07 
 
 		 641 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  29.18 
 
 		 833 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  27.44 
 
 		 819 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  28.2 
 
 		 801 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  26.09 
 
 		 658 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  26.89 
 
 		 812 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  26.38 
 
 		 658 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  27.54 
 
 		 805 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  28.16 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  29.06 
 
 		 686 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  21.12 
 
 		 799 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  29.44 
 
 		 634 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  29.48 
 
 		 774 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  27.48 
 
 		 645 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  22.14 
 
 		 1421 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  27.81 
 
 		 748 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2608  general secretion pathway protein D  25.44 
 
 		 842 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  24.41 
 
 		 720 aa  75.5  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  28.68 
 
 		 779 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  26.98 
 
 		 763 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  28.35 
 
 		 745 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  24.92 
 
 		 807 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  25.41 
 
 		 803 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  28.74 
 
 		 789 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  26.3 
 
 		 673 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  25.48 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  30.18 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  23.03 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  26.28 
 
 		 751 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.89 
 
 		 776 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  24.2 
 
 		 670 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 740 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  24.35 
 
 		 829 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  25.51 
 
 		 682 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  28.16 
 
 		 776 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  26.81 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  26.62 
 
 		 751 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  22.69 
 
 		 733 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  26.97 
 
 		 784 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  30 
 
 		 772 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  26.83 
 
 		 773 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  21.12 
 
 		 675 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  23.64 
 
 		 686 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  23.64 
 
 		 686 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  23.64 
 
 		 686 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  23.64 
 
 		 686 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  30.36 
 
 		 733 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  26.64 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  23.4 
 
 		 660 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  28.22 
 
 		 775 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 736 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  24.06 
 
 		 714 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  20.81 
 
 		 658 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  23.38 
 
 		 705 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  23.62 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  29.71 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  23.33 
 
 		 686 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  25.95 
 
 		 868 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  22.61 
 
 		 724 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  23.95 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  25.6 
 
 		 793 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  23.44 
 
 		 703 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  23.6 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  29.07 
 
 		 766 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  23.18 
 
 		 783 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  25.42 
 
 		 870 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  22.56 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  22.56 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  23.38 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.81 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  20.98 
 
 		 672 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  27.48 
 
 		 780 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  22.35 
 
 		 703 aa  66.6  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  22.19 
 
 		 710 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  22.83 
 
 		 706 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  26.25 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  29.45 
 
 		 702 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  23.51 
 
 		 705 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  24.18 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  24.24 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  22.34 
 
 		 744 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  25.77 
 
 		 753 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  22.69 
 
 		 704 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  25.68 
 
 		 717 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>