More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1402 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  436  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  70.97 
 
 		 225 aa  295  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  55.62 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  53.76 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  51.63 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  55.95 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  48.21 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  48.74 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  48.37 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  49.2 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  51.41 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  47.59 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 160 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  49.37 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 220 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 400 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 410 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 363 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 408 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 309 aa  92.8  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  32.89 
 
 		 403 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 425 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 451 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 451 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 428 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  29.61 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 424 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 406 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  32.08 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 412 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 412 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  28.03 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  27.88 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>