More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2619 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  55.67 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  50.26 
 
 		 221 aa  191  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  53.55 
 
 		 195 aa  191  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 199 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 203 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  36.32 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  36.11 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  34.71 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  34.24 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  28.42 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  55.56 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  34.15 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  21.61 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>