More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1181 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  56.83 
 
 		 1194 aa  1069    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  55.37 
 
 		 1191 aa  992    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  56.03 
 
 		 1227 aa  1041    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  50.41 
 
 		 1217 aa  897    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  65.13 
 
 		 1188 aa  1113    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  58.69 
 
 		 1183 aa  1064    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  56.11 
 
 		 1194 aa  1091    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  55.9 
 
 		 1194 aa  1062    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  66.53 
 
 		 1191 aa  1411    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  56.26 
 
 		 1217 aa  1069    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  93.41 
 
 		 1198 aa  1997    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  54.67 
 
 		 1213 aa  988    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  55.95 
 
 		 1191 aa  1046    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  56.07 
 
 		 1222 aa  1027    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  62.53 
 
 		 1199 aa  1248    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  53.49 
 
 		 1263 aa  967    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  56.94 
 
 		 1181 aa  994    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  55.44 
 
 		 1214 aa  1055    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1198 aa  2308    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  55.12 
 
 		 1203 aa  971    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  41.51 
 
 		 1225 aa  737    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  56.11 
 
 		 1195 aa  1055    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  56.01 
 
 		 1195 aa  1053    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  56.49 
 
 		 1186 aa  1013    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  52.9 
 
 		 1195 aa  973    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  57.71 
 
 		 1224 aa  1186    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  55.43 
 
 		 1205 aa  1026    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  62.28 
 
 		 1194 aa  1289    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.16 
 
 		 1172 aa  684    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  54.03 
 
 		 1222 aa  1033    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  57.7 
 
 		 1188 aa  1011    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  56.47 
 
 		 1188 aa  1127    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  56.01 
 
 		 1195 aa  1053    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  56.82 
 
 		 1234 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  72.46 
 
 		 1218 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 		 1187 aa  493  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.21 
 
 		 1190 aa  479  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  33.18 
 
 		 1179 aa  478  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 		 1185 aa  458  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.31 
 
 		 1186 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.2 
 
 		 1176 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.71 
 
 		 1189 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.41 
 
 		 1176 aa  443  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1189 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1185 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  33.07 
 
 		 1176 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.27 
 
 		 1189 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.85 
 
 		 1176 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.46 
 
 		 1174 aa  429  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.09 
 
 		 1189 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.06 
 
 		 1177 aa  422  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.75 
 
 		 1199 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.26 
 
 		 1199 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1199 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.47 
 
 		 1191 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1188 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1188 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29 
 
 		 1184 aa  406  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.45 
 
 		 1186 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 		 1204 aa  398  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.06 
 
 		 1148 aa  394  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.16 
 
 		 1177 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 		 1177 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.91 
 
 		 1186 aa  357  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.13 
 
 		 1181 aa  340  9e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  32.31 
 
 		 1190 aa  323  9.000000000000001e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  31.9 
 
 		 1175 aa  318  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 		 1170 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 		 1170 aa  308  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.67 
 
 		 1164 aa  300  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.76 
 
 		 1198 aa  295  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  35.77 
 
 		 1185 aa  289  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  47.15 
 
 		 1174 aa  287  8e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  58.82 
 
 		 1186 aa  287  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  57.92 
 
 		 1184 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  30.48 
 
 		 1154 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 		 1403 aa  284  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 		 1196 aa  283  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.87 
 
 		 1189 aa  277  9e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  55.88 
 
 		 1187 aa  274  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.78 
 
 		 1171 aa  266  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.45 
 
 		 1187 aa  265  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.85 
 
 		 1189 aa  262  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.82 
 
 		 1174 aa  259  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  33.53 
 
 		 1301 aa  257  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  21.41 
 
 		 1153 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  49.41 
 
 		 1190 aa  256  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  56.81 
 
 		 1189 aa  254  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  56.81 
 
 		 1189 aa  254  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  57.84 
 
 		 1187 aa  253  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.62 
 
 		 1189 aa  253  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  53.11 
 
 		 1185 aa  248  4.9999999999999997e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  48.19 
 
 		 1081 aa  246  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.91 
 
 		 1178 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 		 1179 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>