196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0242 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  51.01 
 
 
1140 aa  989    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
1146 aa  2294    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  83.75 
 
 
1163 aa  1880    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  40.25 
 
 
1177 aa  773    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1036  membrane-bound mannosyltransferase-like protein  27.32 
 
 
757 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  36.57 
 
 
346 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  36.98 
 
 
831 aa  179  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  36.45 
 
 
930 aa  175  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  37.38 
 
 
522 aa  173  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  35.14 
 
 
579 aa  168  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  34.98 
 
 
668 aa  162  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  38.63 
 
 
1293 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  34.45 
 
 
676 aa  158  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  34.56 
 
 
491 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.92 
 
 
343 aa  148  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  32.82 
 
 
387 aa  145  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  38.25 
 
 
752 aa  141  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  35.57 
 
 
930 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  34.09 
 
 
709 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  42.27 
 
 
391 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.94 
 
 
627 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0497  hypothetical protein  23.34 
 
 
550 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.551431  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  30.23 
 
 
588 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3866  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
848 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0292  glycosyl transferase family protein  37.56 
 
 
832 aa  131  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.395446  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  32.91 
 
 
390 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.71 
 
 
307 aa  127  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0243  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
838 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  34.67 
 
 
392 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3474  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
830 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.337129  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  36.14 
 
 
319 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1555  glycosyl transferase family 39  33.33 
 
 
608 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  31.13 
 
 
525 aa  112  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  34.55 
 
 
343 aa  110  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
560 aa  108  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.65 
 
 
355 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  36.71 
 
 
1030 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  32.47 
 
 
372 aa  104  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
543 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  35.03 
 
 
353 aa  103  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.1 
 
 
1351 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  34.2 
 
 
347 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.58 
 
 
2296 aa  103  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  33.7 
 
 
700 aa  102  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.48 
 
 
1030 aa  101  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.09 
 
 
1750 aa  100  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  34.07 
 
 
439 aa  99  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1439  hypothetical protein  34.78 
 
 
540 aa  98.6  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.71 
 
 
355 aa  98.6  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  30 
 
 
354 aa  97.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  29.66 
 
 
664 aa  97.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  31.76 
 
 
1079 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
850 aa  97.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
786 aa  95.9  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  30.88 
 
 
436 aa  95.9  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.73 
 
 
373 aa  95.5  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.52 
 
 
361 aa  94  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.63 
 
 
365 aa  94.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.75 
 
 
693 aa  93.2  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  26.3 
 
 
360 aa  94  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  33.16 
 
 
418 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  32.81 
 
 
368 aa  92  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  35.5 
 
 
1763 aa  90.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 
732 aa  90.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  33.03 
 
 
646 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1594  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
515 aa  87.4  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 
343 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  35.05 
 
 
359 aa  87  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  29.58 
 
 
384 aa  87.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  34.45 
 
 
1026 aa  84  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.62 
 
 
1292 aa  83.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  25.55 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  36.1 
 
 
963 aa  82.4  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.58 
 
 
1068 aa  82  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  30.2 
 
 
1046 aa  81.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.89 
 
 
321 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  27.07 
 
 
903 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  30.77 
 
 
1051 aa  80.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  27.16 
 
 
396 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
772 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  28.78 
 
 
386 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  30.16 
 
 
379 aa  79  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 
892 aa  79  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  29.89 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  28.64 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.41 
 
 
1130 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  31.66 
 
 
364 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  30.66 
 
 
412 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  26.26 
 
 
639 aa  77  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 
719 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  27.69 
 
 
297 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.18 
 
 
323 aa  76.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  28.45 
 
 
898 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  28.71 
 
 
297 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  29.89 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.25 
 
 
1834 aa  75.5  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0068  PurK operon protein / membrane-bound mannosyltransferase  30.64 
 
 
580 aa  74.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0587914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  28.77 
 
 
318 aa  73.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  31.58 
 
 
623 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
1230 aa  71.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>