106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2184 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.98 
 
 
1607 aa  741    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 
1507 aa  3028    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.89 
 
 
1383 aa  348  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  55.13 
 
 
1848 aa  337  9e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.13 
 
 
1221 aa  329  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  55.19 
 
 
2802 aa  329  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.66 
 
 
810 aa  322  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  51.59 
 
 
1195 aa  321  7.999999999999999e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.66 
 
 
826 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.58 
 
 
714 aa  316  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  49.15 
 
 
1178 aa  305  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  48.55 
 
 
1255 aa  303  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.11 
 
 
887 aa  302  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  49.28 
 
 
633 aa  299  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  47.03 
 
 
721 aa  298  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.82 
 
 
805 aa  297  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  49.41 
 
 
791 aa  297  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  47.24 
 
 
920 aa  297  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  49.13 
 
 
1292 aa  296  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.3 
 
 
540 aa  295  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  48.41 
 
 
884 aa  294  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.97 
 
 
1126 aa  293  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  48.41 
 
 
701 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.08 
 
 
1130 aa  290  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  47.89 
 
 
1026 aa  287  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  48.88 
 
 
1176 aa  283  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.59 
 
 
408 aa  281  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.86 
 
 
1183 aa  280  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  47.18 
 
 
862 aa  273  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.01 
 
 
1176 aa  268  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  43.64 
 
 
640 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.32 
 
 
664 aa  262  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  46.02 
 
 
933 aa  257  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  50.96 
 
 
1285 aa  256  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  45.54 
 
 
462 aa  256  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  44.02 
 
 
3563 aa  234  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  47.92 
 
 
648 aa  213  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  38.36 
 
 
288 aa  179  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  29.89 
 
 
1969 aa  154  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  41.42 
 
 
1083 aa  152  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.85 
 
 
2713 aa  129  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  43.46 
 
 
14944 aa  111  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.29 
 
 
1288 aa  110  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.36 
 
 
1657 aa  92.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.22 
 
 
1329 aa  90.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.04 
 
 
3793 aa  90.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.52 
 
 
1266 aa  89.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.31 
 
 
1550 aa  86.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  28.4 
 
 
1108 aa  85.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  22.81 
 
 
2024 aa  80.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.12 
 
 
991 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.66 
 
 
1362 aa  73.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  30.23 
 
 
1170 aa  73.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  40.19 
 
 
2003 aa  72  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  28.25 
 
 
1976 aa  68.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  26.09 
 
 
1247 aa  68.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  32.91 
 
 
953 aa  68.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  25.61 
 
 
904 aa  68.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.08 
 
 
1079 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  25.91 
 
 
910 aa  66.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  37.35 
 
 
1132 aa  66.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  22.77 
 
 
3834 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  28.35 
 
 
794 aa  61.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  26.71 
 
 
1750 aa  61.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  26.34 
 
 
496 aa  59.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  28.14 
 
 
1585 aa  58.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  28.14 
 
 
1217 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  28.16 
 
 
972 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  32.43 
 
 
1100 aa  57.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  30.43 
 
 
775 aa  57.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  31.15 
 
 
994 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  30.52 
 
 
532 aa  57  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  27.71 
 
 
1002 aa  56.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1423  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.45 
 
 
139 aa  56.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.3 
 
 
752 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  33.12 
 
 
1216 aa  54.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  23.96 
 
 
1345 aa  54.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  23.45 
 
 
5453 aa  53.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  42.86 
 
 
441 aa  53.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  26.65 
 
 
1474 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  27.73 
 
 
2411 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  25.1 
 
 
483 aa  52.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  27.08 
 
 
2367 aa  52.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  24.65 
 
 
4120 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.16 
 
 
1094 aa  51.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1083  immunoglobulin I-set domain protein  38.36 
 
 
134 aa  51.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  29.02 
 
 
861 aa  50.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  26.79 
 
 
2487 aa  49.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  22.88 
 
 
1100 aa  49.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  29.91 
 
 
317 aa  49.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  21.69 
 
 
2402 aa  48.5  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  29.63 
 
 
577 aa  48.5  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  25.38 
 
 
859 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  25.49 
 
 
979 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  24.81 
 
 
2454 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  24.81 
 
 
2807 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  24.81 
 
 
2421 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0645  gp16  40.28 
 
 
246 aa  47.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  22.83 
 
 
1064 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3031  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  46.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>