19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1083 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1083  immunoglobulin I-set domain protein  100 
 
 		 134 aa  273  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  83.72 
 
 		 238 aa  224  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  83.72 
 
 		 238 aa  224  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1195  hypothetical protein  63.71 
 
 		 234 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000320385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.36 
 
 		 1607 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  40.26 
 
 		 1550 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.36 
 
 		 1507 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  39.47 
 
 		 14944 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  34.25 
 
 		 2713 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.78 
 
 		 1362 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  37.31 
 
 		 1132 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  32.69 
 
 		 3563 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.18 
 
 		 1176 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2230  phage major tail subunit  62.07 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.46 
 
 		 1130 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  31.4 
 
 		 1170 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1969 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1686  gp11  46.67 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.29 
 
 		 887 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>