202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4367 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  41.71 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.24 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  36.57 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 367 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  35.64 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 244 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  28.42 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 289 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 290 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  28.8 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>