237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1242 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 629 aa  1301    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  58.65 
 
 		 630 aa  731    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  66.41 
 
 		 681 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  44.77 
 
 		 1217 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  41.99 
 
 		 413 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  63.16 
 
 		 604 aa  298  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  75.5 
 
 		 1164 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  60.24 
 
 		 541 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  67.98 
 
 		 746 aa  290  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  65.14 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  65.17 
 
 		 1122 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  39.8 
 
 		 406 aa  280  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  63.23 
 
 		 780 aa  276  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  66.33 
 
 		 1015 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  51.9 
 
 		 965 aa  223  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  56.04 
 
 		 490 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  52.68 
 
 		 928 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  52.45 
 
 		 501 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  50.43 
 
 		 951 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  39.08 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  50.46 
 
 		 524 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  52.04 
 
 		 535 aa  185  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  47.44 
 
 		 533 aa  171  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  44.83 
 
 		 679 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  43 
 
 		 837 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 		 683 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  53.08 
 
 		 912 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  30 
 
 		 532 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  45.24 
 
 		 464 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  44.97 
 
 		 618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  39.2 
 
 		 1290 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  41.79 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  44.03 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  41.79 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  41.79 
 
 		 470 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  43.18 
 
 		 469 aa  97.4  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  26.44 
 
 		 726 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  23.98 
 
 		 688 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  39.85 
 
 		 464 aa  87.4  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.87 
 
 		 945 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  36.22 
 
 		 1186 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  26.62 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  34.06 
 
 		 1444 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.42 
 
 		 953 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.33 
 
 		 627 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.91 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  33.6 
 
 		 630 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.54 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  36.92 
 
 		 541 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  46.25 
 
 		 988 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  34.92 
 
 		 536 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  53.12 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  50.67 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  50.77 
 
 		 295 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  35.35 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  33.1 
 
 		 1132 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  52.46 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  41.41 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  47.06 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  36 
 
 		 610 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  49.21 
 
 		 955 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  34.38 
 
 		 389 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  23.77 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  42.53 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  47.37 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  52.38 
 
 		 732 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  27.17 
 
 		 1338 aa  65.1  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.35 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  52.46 
 
 		 725 aa  64.7  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 		 873 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  47.89 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  34.62 
 
 		 863 aa  63.9  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  40.78 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.07 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  29.58 
 
 		 797 aa  63.9  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.87 
 
 		 982 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  43.84 
 
 		 707 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  44.26 
 
 		 621 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  43.53 
 
 		 391 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  52.46 
 
 		 583 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  23.77 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  34.11 
 
 		 957 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  33.61 
 
 		 801 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  46.15 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.22 
 
 		 648 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  27.54 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  49.21 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  27.39 
 
 		 884 aa  61.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  49.21 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  51.56 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  42.86 
 
 		 949 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  23.75 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  51.67 
 
 		 885 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  49.21 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 961 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.14 
 
 		 401 aa  60.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  53.33 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  58.18 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  41.27 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>