More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0096 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0096  diguanylate cyclase  100 
 
 
555 aa  1098  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  34.28 
 
 
546 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6137  diguanylate cyclase  34.78 
 
 
551 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11555  normal  0.0857113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.2 
 
 
609 aa  130  9e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32350  diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  39.2 
 
 
628 aa  129  1e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  34.39 
 
 
568 aa  127  4e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.59 
 
 
668 aa  127  8e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  41.49 
 
 
381 aa  126  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  39 
 
 
355 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.59 
 
 
668 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1665  diguanylate cyclase  33.43 
 
 
530 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772741  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4658  hypothetical protein  40.85 
 
 
818 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1952  hypothetical protein  37.88 
 
 
306 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00612967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23130  sensory box GGDEF domain-containing protein  40.99 
 
 
307 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.561543  decreased coverage  8.66239e-05 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0698  diguanylate cyclase  45.66 
 
 
388 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814063  hitchhiker  0.00133482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  41.92 
 
 
527 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  43.12 
 
 
532 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0676  diguanylate cyclase  45.66 
 
 
388 aa  123  1e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  43.31 
 
 
493 aa  122  1e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.35 
 
 
642 aa  123  1e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53140  hypothetical protein  39.63 
 
 
823 aa  122  2e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807959  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  40.12 
 
 
513 aa  122  2e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  40 
 
 
661 aa  121  4e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.04 
 
 
560 aa  121  4e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1657  diguanylate cyclase  33.89 
 
 
530 aa  121  4e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  38.86 
 
 
432 aa  120  5e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
493 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1842  diguanylate cyclase  42.86 
 
 
308 aa  120  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.721538  normal  0.677546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0963  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.23 
 
 
300 aa  120  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2425  diguanylate cyclase  40.34 
 
 
353 aa  119  1e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4028  diguanylate cyclase  35.44 
 
 
447 aa  120  1e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.33 
 
 
817 aa  119  1e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  41.42 
 
 
608 aa  119  1e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  41.46 
 
 
758 aa  118  2e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  45.1 
 
 
202 aa  119  2e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
523 aa  118  2e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  35.2 
 
 
775 aa  119  2e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0233  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  40.69 
 
 
513 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.92 
 
 
634 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1761  sensory box protein/GGDEF family protein  43.48 
 
 
973 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869454  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  41.32 
 
 
1037 aa  118  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.21 
 
 
704 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3643  diguanylate cyclase  37.9 
 
 
516 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93603  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  40.12 
 
 
471 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.11 
 
 
791 aa  117  4e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1739  GGDEF domain protein  39.13 
 
 
308 aa  117  4e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  41.4 
 
 
493 aa  117  4e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.48 
 
 
818 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260128  decreased coverage  0.0078854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  39.63 
 
 
696 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2021  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  38.12 
 
 
811 aa  117  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0831  diguanylate cyclase  26.64 
 
 
627 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.21 
 
 
713 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1035  GGDEF domain-containing protein  35.67 
 
 
544 aa  117  7e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00577049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0658  diguanylate cyclase  40.28 
 
 
547 aa  117  7e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4084  diguanylate cyclase  39.75 
 
 
308 aa  115  1e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.11 
 
 
772 aa  116  1e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6813  diguanylate cyclase  37.62 
 
 
285 aa  115  1e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  40.23 
 
 
381 aa  116  1e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  41.9 
 
 
591 aa  115  1e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1352  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.86 
 
 
818 aa  116  1e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455203  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  34.5 
 
 
794 aa  115  2e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1946  diguanylate cyclase  40.49 
 
 
368 aa  115  2e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0707577  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0629  GGDEF domain-containing protein  39.24 
 
 
626 aa  115  2e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  37.64 
 
 
351 aa  115  2e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1927  diguanylate cyclase  41.04 
 
 
340 aa  115  2e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0449945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1368  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.88 
 
 
818 aa  115  2e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.567434  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39460  guanylyl cyclase  44.25 
 
 
415 aa  115  2e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2332  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.98 
 
 
324 aa  115  2e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.532356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0266  GGDEF  38.66 
 
 
690 aa  115  2e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  35.63 
 
 
368 aa  115  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  36.84 
 
 
631 aa  115  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  37.93 
 
 
490 aa  115  2e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.12 
 
 
951 aa  115  2e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  43.02 
 
 
312 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2986  diguanylate cyclase  37.08 
 
 
352 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3414  diguanylate cyclase  38.92 
 
 
444 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2824  GGDEF domain-containing protein  34.89 
 
 
628 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2682  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  38.55 
 
 
596 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  36.31 
 
 
798 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  33.85 
 
 
487 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0892  diguanylate cyclase  43.9 
 
 
553 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1144  signal transduction protein  41.21 
 
 
571 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  40.85 
 
 
523 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3653  GGDEF  37.89 
 
 
308 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.203802  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  41.14 
 
 
382 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.86 
 
 
306 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 
1643 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  39.6 
 
 
506 aa  114  4e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1155  diguanylate cyclase  38.29 
 
 
357 aa  114  4e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2413  diguanylate cyclase  41.82 
 
 
544 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1914  GGDEF domain-containing protein  38.95 
 
 
381 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.743896  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  38.86 
 
 
432 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  42.22 
 
 
386 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1220  GGDEF domain-containing protein  35.67 
 
 
545 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  39.87 
 
 
425 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  39.6 
 
 
506 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0266  diguanylate cyclase  38.66 
 
 
942 aa  114  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.955306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4260  diguanylate cyclase  37.79 
 
 
360 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  8.60912e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  39.02 
 
 
492 aa  114  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40 
 
 
958 aa  114  7e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>