124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1425 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  49.13 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0856  HTH DNA binding domain-containing protein  37.07 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.94 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0287  bacterio-opsin activator  31.73 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.02 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  26.36 
 
 		 843 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.95 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.6 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.71 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  36.59 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.69 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  45.61 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.55 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.6 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  39.44 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.44 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.7 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.71 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.18 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  40 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.61 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.83 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.79 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 		 952 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 781 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3736  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.21 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.14 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.7 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  30.26 
 
 		 677 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.83 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.58 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.8 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.67 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.83 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.11 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 		 770 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.48 
 
 		 247 aa  48.5  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.74 
 
 		 245 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.69 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3232  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.87 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.14 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38 
 
 		 220 aa  47.8  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  38.18 
 
 		 236 aa  47.8  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.58 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.5 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.8 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.66 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  20.56 
 
 		 532 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1428  bacterio-opsin activator  29.41 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0374788 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.2 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 		 994 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.48 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.67 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.62 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  25.17 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  32.88 
 
 		 750 aa  45.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  27.03 
 
 		 737 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  27.96 
 
 		 1059 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.89 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.93 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.19 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.67 
 
 		 282 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  31.91 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.98 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  25.97 
 
 		 807 aa  45.1  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2083  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.58 
 
 		 251 aa  44.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.152558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.35 
 
 		 222 aa  44.7  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.63 
 
 		 240 aa  44.7  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.87 
 
 		 336 aa  44.7  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  37.74 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  25 
 
 		 680 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.23 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.71 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  24.22 
 
 		 712 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.85 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1803  bacterio-opsin activator  35.71 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000152108  normal  0.762751 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.36 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1609  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.680269  normal  0.358173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.3 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.07 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.54 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.15 
 
 		 637 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4963  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.35 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.993638  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 1073 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.81 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.03 
 
 		 564 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.63 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 553 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>