85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0803 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  55.87 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.74 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.42 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2148  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.02 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.58 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.32 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.59 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.49 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.13 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.64 
 
 		 336 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.22 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2268  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.84 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0657053  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.92 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.25 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.02 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.7 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.46 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.52 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.28 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.72 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.02 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0022  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.95 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.31 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.17 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.71 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.83 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.5 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.46 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  28.08 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.88 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.88 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.65 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.36 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.25 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.2 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.58 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.6 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.06 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.33 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.63 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.44 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.66 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 539 aa  48.9  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  26.11 
 
 		 982 aa  48.5  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.1 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  25.7 
 
 		 728 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.66 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  21.54 
 
 		 247 aa  48.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  40.74 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.68 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.15 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.17 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.43 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.68 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.54 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  32.5 
 
 		 781 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.19 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.88 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1609  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.6 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.680269  normal  0.358173 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.33 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.51 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  23.81 
 
 		 379 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.29 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  21.52 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.33 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.08 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  26.07 
 
 		 843 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.69 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.09 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.81 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.81 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.93 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1773  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.58 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133955  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.12 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 208 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.07 
 
 		 236 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.22 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  27.27 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>