130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0915 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.06 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.04 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.3 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.04 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.26 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.21 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.1 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.77 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.37 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.41 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.37 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.82 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.28 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.97 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.61 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.75 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.25 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.23 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.61 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.44 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  52.54 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.98 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.16 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.31 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.04 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.47 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.68 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.17 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2268  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.05 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0657053  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.16 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.89 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0022  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.39 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.51 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2148  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.61 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.63 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.76 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.18 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  54.72 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3730  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  53.85 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  51.92 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.92 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.36 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.17 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.55 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.08 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.33 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.9 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.9 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  56.86 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.33 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.64 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.83 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.3 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1416  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.81 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.928147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  41.33 
 
 		 919 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.61 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.67 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.42 
 
 		 262 aa  51.6  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  32.11 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  40.79 
 
 		 532 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.4 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.08 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  40 
 
 		 539 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.18 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1971  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.56 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.05 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  37.8 
 
 		 781 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  52.94 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.28 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.79 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.23 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.89 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.64 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.45 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.66 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  40 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  37.33 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.6 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  42.37 
 
 		 737 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.65 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  40.35 
 
 		 666 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1185  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.17 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2789  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.44 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.92 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  40.32 
 
 		 843 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2083  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.6 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.152558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  40.51 
 
 		 807 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.1 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4963  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.993638  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  35 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  40.35 
 
 		 1071 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>