90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4199 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.96 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.37 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.38 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.39 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.58 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.71 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.37 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.14 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.36 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.56 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.49 
 
 		 252 aa  85.1  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.45 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.78 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.02 
 
 		 336 aa  81.6  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.44 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.52 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.28 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.3 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.2 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2148  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.36 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.12 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.38 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.73 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0022  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.59 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.94 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.57 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.74 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  28.18 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.47 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.61 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.91 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.94 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.84 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.83 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2268  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.78 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0657053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.9 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.16 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.5 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.75 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.84 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  30.36 
 
 		 781 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.68 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.11 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  37.29 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  45.28 
 
 		 737 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.11 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.33 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2083  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.152558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  45.28 
 
 		 807 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.62 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0779  bacterio-opsin activator  35.48 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.81 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.93 
 
 		 598 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  36.07 
 
 		 379 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  37.04 
 
 		 532 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3232  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.88 
 
 		 247 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.68 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1221  bacterio-opsin activator  44.19 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.77 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.4 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.25 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.09 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  26.55 
 
 		 666 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.84 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.38 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.23 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 		 843 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1185  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.12 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.8 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.21 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.71 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2789  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.71 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.6 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.69 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.18 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  37.68 
 
 		 1216 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.6 
 
 		 637 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1307  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.63 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.58 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1773  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25 
 
 		 239 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133955  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 539 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.54 
 
 		 225 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.54 
 
 		 251 aa  41.6  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.08 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>