46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0779 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0779  bacterio-opsin activator  100 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0917  bacterio-opsin activator  43.67 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  42.22 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  42.67 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  34.75 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  32.23 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.48 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.34 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  28.97 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.58 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.76 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.48 
 
 		 728 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 532 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  25.85 
 
 		 982 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0032  bacterio-opsin activator  30.66 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  24.77 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.62 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  29.85 
 
 		 896 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.48 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  32.84 
 
 		 553 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.85 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.1 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1803  bacterio-opsin activator  24.48 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000152108  normal  0.762751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.9 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  32.1 
 
 		 843 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 		 919 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.03 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.53 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.85 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.03 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  30.69 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.89 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 		 1260 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.12 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 		 677 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.65 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0287  bacterio-opsin activator  35.59 
 
 		 207 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.19 
 
 		 222 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  25.49 
 
 		 1589 aa  42  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.48 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>