43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1803 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1803  bacterio-opsin activator  100 
 
 		 229 aa  463  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000152108  normal  0.762751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  30.45 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  31.14 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  25.76 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0032  bacterio-opsin activator  28.26 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  27.44 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  32.74 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  23.32 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.21 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  41.67 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.89 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.03 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  24.66 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  31.43 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  23.21 
 
 		 254 aa  48.5  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  26.02 
 
 		 553 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0917  bacterio-opsin activator  22.27 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0287  bacterio-opsin activator  27.27 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.53 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  26.47 
 
 		 537 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.43 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  39.29 
 
 		 843 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0779  bacterio-opsin activator  24.48 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.62 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.14 
 
 		 728 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.13 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  26.15 
 
 		 680 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.83 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.86 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  27.71 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0992  bacterio-opsin activator  24.19 
 
 		 178 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000881658  hitchhiker  0.00988265 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 532 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 1589 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 644 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 781 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.09 
 
 		 220 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4044  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.99 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>