108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1720 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  100 
 
 
229 aa  457  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.16 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.33 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  28.64 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  28.02 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.91 
 
 
269 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  30.13 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.29 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.17 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
781 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.44 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.59 
 
 
194 aa  55.5  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  44.23 
 
 
843 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.9 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
539 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.51 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.96 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  51.85 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0992  bacterio-opsin activator  30.13 
 
 
178 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000881658  hitchhiker  0.00988265 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  41.54 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.87 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.59 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.67 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  49.06 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 
553 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.67 
 
 
598 aa  52.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.15 
 
 
245 aa  52  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.67 
 
 
252 aa  52  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.04 
 
 
243 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.33 
 
 
251 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.1 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  44.07 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  26.62 
 
 
666 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.13 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.71 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.54 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.25 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.94 
 
 
637 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0779  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.22 
 
 
564 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
919 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1803  bacterio-opsin activator  24.66 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000152108  normal  0.762751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  42.31 
 
 
644 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.67 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  29.09 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 
537 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.33 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.1 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  38.98 
 
 
1059 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.11 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.7 
 
 
216 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.14 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 
1589 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.2 
 
 
240 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.67 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.89 
 
 
700 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  39.62 
 
 
1071 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  35.19 
 
 
1260 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.29 
 
 
712 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.29 
 
 
728 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 
991 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 
237 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  38.24 
 
 
524 aa  45.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  41.51 
 
 
532 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  32.08 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  37.74 
 
 
680 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3232  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.22 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.73 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.21 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 
982 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  32.61 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 
994 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.13 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.77 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 
750 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  31.75 
 
 
1969 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.95 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.79 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 
1073 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 
1216 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 
807 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.78 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.78 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.8 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 
1154 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  42.31 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.35 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.03 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.18 
 
 
245 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 
737 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.96 
 
 
223 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>