101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4716 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0022  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.02 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.26 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.81 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.61 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.23 
 
 		 220 aa  95.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.05 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.34 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.19 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.05 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.11 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.06 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.1 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.23 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.64 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.55 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.85 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.63 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.12 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.8 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.28 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2148  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.17 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.18 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.77 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.78 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.59 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.62 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.88 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.23 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.56 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.14 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.07 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2268  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.54 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0657053  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0745  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.77 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 532 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0917  bacterio-opsin activator  42.86 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.96 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.15 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.94 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.43 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0779  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 781 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.77 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1185  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.22 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  40.32 
 
 		 1059 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.6 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.37 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  25.2 
 
 		 229 aa  48.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.44 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.41 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.19 
 
 		 700 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.29 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 		 807 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3736  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.06 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  29.52 
 
 		 666 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  26.95 
 
 		 1071 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.29 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.43 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  41.51 
 
 		 524 aa  45.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3730  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.69 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1971  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.49 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.19 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0856  HTH DNA binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0287  bacterio-opsin activator  36.54 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.98 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2083  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.87 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.152558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 737 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  32.79 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.62 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  34.67 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.94 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  34.62 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  32.14 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.43 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.89 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.19 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 598 aa  42.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.33 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 		 991 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 896 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  29.11 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  38.71 
 
 		 1073 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.71 
 
 		 637 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.21 
 
 		 212 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  31.82 
 
 		 677 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  38.33 
 
 		 1589 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.85 
 
 		 269 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.87 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.78 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>