72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0874 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1803  bacterio-opsin activator  30.45 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000152108  normal  0.762751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  30.04 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  26.5 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  28.02 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.1 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0917  bacterio-opsin activator  24.65 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.68 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0779  bacterio-opsin activator  32.23 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.37 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0287  bacterio-opsin activator  39.51 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100333 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  21.46 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  45 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.61 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.31 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0032  bacterio-opsin activator  24.35 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.52 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.72 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.29 
 
 		 728 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.93 
 
 		 267 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.2 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  35.59 
 
 		 896 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  28.37 
 
 		 553 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.29 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  38.67 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.46 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.83 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  41.07 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0856  HTH DNA binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  26.26 
 
 		 537 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.66 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.83 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 539 aa  45.1  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 532 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 		 781 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 		 843 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  22.17 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  28.8 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.4 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.35 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.84 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.67 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 		 524 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.45 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  39.22 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  23.32 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.16 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  37.5 
 
 		 680 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 666 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.67 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.72 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 		 1073 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 379 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.05 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.85 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.11 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 228 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 919 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.08 
 
 		 237 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 770 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4044  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.06 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.71 
 
 		 251 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 994 aa  41.6  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>