12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0032 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0032  bacterio-opsin activator  100 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1803  bacterio-opsin activator  28.7 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000152108  normal  0.762751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0779  bacterio-opsin activator  30.66 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  24.77 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0917  bacterio-opsin activator  30.58 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  23.93 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  27.35 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  23.29 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1221  bacterio-opsin activator  25.11 
 
 		 215 aa  45.8  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  23.18 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  25.76 
 
 		 229 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>