76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1820 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.81 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 781 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.07 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.38 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  51.02 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.45 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0992  bacterio-opsin activator  35.53 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000881658  hitchhiker  0.00988265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.74 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 919 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 994 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.5 
 
 		 564 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  36.36 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.43 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.41 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  43.64 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 539 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 1260 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 		 1073 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  32.76 
 
 		 1059 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1336  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.57 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292593  normal  0.783067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.19 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 		 598 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.85 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.93 
 
 		 637 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.17 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.88 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.26 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 		 737 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  42.55 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.97 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 770 aa  45.1  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.91 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.79 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.62 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  32.08 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  22.96 
 
 		 750 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.58 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.69 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 		 532 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 		 1969 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.58 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.31 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  39.22 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 843 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.85 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 1216 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.55 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.08 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.31 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.62 
 
 		 712 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.73 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  24.35 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  38.18 
 
 		 807 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.6 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.96 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.55 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.27 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  31.15 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  34.92 
 
 		 1589 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.69 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 		 677 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.58 
 
 		 212 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.34 
 
 		 225 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.85 
 
 		 217 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.76 
 
 		 216 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  30.91 
 
 		 553 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>