46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0992 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0992  bacterio-opsin activator  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000881658  hitchhiker  0.00988265 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  42.69 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.48 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  30.49 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1221  bacterio-opsin activator  27.22 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  31.9 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.85 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  30.13 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  35.53 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.17 
 
 		 233 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  44.23 
 
 		 532 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 781 aa  48.5  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 251 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 		 666 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.69 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  30.11 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  38.18 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  38.98 
 
 		 991 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 539 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 		 1059 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.09 
 
 		 211 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4044  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.18 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1609  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.72 
 
 		 243 aa  44.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.680269  normal  0.358173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 		 1154 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.84 
 
 		 712 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  36.54 
 
 		 994 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.67 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1803  bacterio-opsin activator  24.19 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000152108  normal  0.762751 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.77 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.2 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 524 aa  42  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.55 
 
 		 214 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.73 
 
 		 242 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.11 
 
 		 245 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  36.54 
 
 		 553 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.62 
 
 		 237 aa  42  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 		 982 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 1589 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.04 
 
 		 223 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  36.54 
 
 		 919 aa  41.6  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.54 
 
 		 225 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.55 
 
 		 564 aa  41.2  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  35.09 
 
 		 680 aa  40.8  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>