138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1621 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  100 
 
 
228 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.25 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  45.9 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.77 
 
 
217 aa  62  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  43.33 
 
 
781 aa  61.6  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.87 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.69 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.78 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.07 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.06 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.31 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.22 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1803  bacterio-opsin activator  32.74 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000152108  normal  0.762751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 
1059 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  42.62 
 
 
994 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  39.39 
 
 
1071 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  37.38 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.67 
 
 
564 aa  55.1  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1307  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.26 
 
 
216 aa  55.1  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.46 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40 
 
 
637 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  27.06 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1609  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.21 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.680269  normal  0.358173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  41.07 
 
 
644 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  36.23 
 
 
834 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.17 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  51.85 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1336  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.65 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292593  normal  0.783067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.1 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
843 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  21.66 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  43.28 
 
 
537 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 
1216 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.29 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.73 
 
 
217 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.03 
 
 
232 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 
807 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.48 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
750 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.93 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 
737 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  38.71 
 
 
553 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.11 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 
1073 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  36.36 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  23.94 
 
 
680 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.56 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.53 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.29 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.09 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.93 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.96 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.34 
 
 
598 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  35.82 
 
 
532 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.66 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.82 
 
 
216 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.94 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.07 
 
 
233 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.68 
 
 
216 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.33 
 
 
218 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.32 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.37 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.67 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.48 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
1081 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.29 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  34.92 
 
 
919 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  29.51 
 
 
1589 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.06 
 
 
219 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.59 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1330  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.01 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0992  bacterio-opsin activator  38.18 
 
 
178 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000881658  hitchhiker  0.00988265 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  41.07 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.29 
 
 
212 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.67 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  30.51 
 
 
666 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
770 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
1969 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  32.31 
 
 
991 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.29 
 
 
336 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  37.04 
 
 
539 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.11 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 
524 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1185  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.85 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.82 
 
 
225 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0287  bacterio-opsin activator  47.17 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0100333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>