92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1916 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  61.61 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.43 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2789  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.18 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.6 
 
 		 198 aa  95.9  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1185  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.82 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3736  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.04 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.84 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.83 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.33 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0745  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.08 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1971  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.38 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3730  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.17 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4963  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.09 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.993638  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1416  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.62 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.928147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.37 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  51.92 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.23 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.51 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  48.33 
 
 		 919 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1609  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.37 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.680269  normal  0.358173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  21.03 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.84 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  35.35 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.7 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.76 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 532 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.21 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.68 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4044  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.27 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  38.38 
 
 		 677 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  40.98 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.17 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  31.82 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.27 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  45 
 
 		 994 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 807 aa  48.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 		 737 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  34.04 
 
 		 1589 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.09 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.5 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  39.68 
 
 		 1071 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  46.15 
 
 		 712 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0856  HTH DNA binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.42 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.62 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.88 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.14 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.15 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  40.32 
 
 		 680 aa  45.1  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.61 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.35 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.59 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  29.56 
 
 		 781 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.74 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  41.77 
 
 		 539 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1307  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.67 
 
 		 598 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.86 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.59 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  40.35 
 
 		 553 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.68 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.85 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.52 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 		 537 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.6 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.21 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  43.4 
 
 		 700 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  35.19 
 
 		 770 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.66 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 379 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3232  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.68 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.67 
 
 		 728 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.63 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.91 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.82 
 
 		 212 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.76 
 
 		 222 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  33.78 
 
 		 750 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 		 267 aa  41.6  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 		 1081 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.48 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1773  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.18 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133955  normal  0.527936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>