69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1467 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3232  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  73.64 
 
 		 247 aa  355  5.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2083  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  65.87 
 
 		 251 aa  324  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.152558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  57.63 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  53.39 
 
 		 262 aa  255  6e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1773  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.87 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133955  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.12 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.67 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3316  transcription regulator  33.33 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1416  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.928147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.25 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.67 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.95 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.33 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.74 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.31 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.11 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  42.86 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.62 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.58 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.18 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 539 aa  49.7  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.48 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.62 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.69 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  28.03 
 
 		 982 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.7 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.15 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.3 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.68 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.59 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.24 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  43.08 
 
 		 666 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  39.66 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.14 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.13 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.14 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 553 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1609  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.71 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.680269  normal  0.358173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.56 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.47 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.72 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.6 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.92 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.59 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.06 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  32.76 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.63 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4044  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.1 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  20.81 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.06 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.37 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.73 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.19 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 		 737 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.2 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1307  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.02 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.55 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.8 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.38 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 		 781 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  34.38 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  30.16 
 
 		 236 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.82 
 
 		 261 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>