65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1609 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1609  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 243 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.680269  normal  0.358173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.86 
 
 		 223 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.82 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.8 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.38 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.94 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.21 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.33 
 
 		 216 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  36.21 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  31.82 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  43.66 
 
 		 781 aa  52.4  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  40 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.64 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.34 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50 
 
 		 336 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.83 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 		 807 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  51.02 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.14 
 
 		 254 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.6 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.11 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.14 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1416  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.928147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  29.61 
 
 		 666 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1307  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.85 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.35 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  38.36 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.64 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.29 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1773  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133955  normal  0.527936 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.81 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.73 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.51 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.91 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.59 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.04 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.71 
 
 		 248 aa  45.4  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.94 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.53 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  40.32 
 
 		 737 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.75 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.77 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2789  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.57 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.25 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.3 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0992  bacterio-opsin activator  28.72 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000881658  hitchhiker  0.00988265 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.12 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.27 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4044  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.84 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.1 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.55 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0745  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.15 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2148  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.92 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.82 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.25 
 
 		 221 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 225 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>