110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5265 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 
261 aa  523  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  71.1 
 
 
252 aa  318  7e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.39 
 
 
220 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.79 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.03 
 
 
219 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.06 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.29 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.92 
 
 
220 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.38 
 
 
225 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0022  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.67 
 
 
212 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.55 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  29.72 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.26 
 
 
282 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.16 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.81 
 
 
217 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30 
 
 
218 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.32 
 
 
234 aa  89  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.12 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.56 
 
 
222 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.05 
 
 
336 aa  85.9  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.53 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.08 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.76 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2268  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.76 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0657053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.35 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.74 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.51 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.73 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.06 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.5 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.77 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.71 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.94 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.66 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.8 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2148  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.95 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.12 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  29.52 
 
 
843 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.48 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.41 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  34.71 
 
 
781 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.15 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.45 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  29.28 
 
 
1589 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  46.67 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  55.32 
 
 
212 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  49.02 
 
 
216 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  50 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.4 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.64 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  49.02 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.376483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.83 
 
 
194 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.83 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.17 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  39.29 
 
 
224 aa  49.3  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33 
 
 
211 aa  48.9  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.8 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.62 
 
 
201 aa  48.9  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  53.19 
 
 
214 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  31.68 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.94 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.04 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.73 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
379 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.96 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  35.23 
 
 
539 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1307  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.44 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  46.81 
 
 
666 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.11 
 
 
216 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  28.12 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.14 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0745  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  51.06 
 
 
221 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.06 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  32.97 
 
 
192 aa  46.2  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.14 
 
 
208 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.43 
 
 
223 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  45.83 
 
 
223 aa  45.8  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  33.63 
 
 
991 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  29.85 
 
 
524 aa  45.8  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.13 
 
 
564 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.99 
 
 
267 aa  45.4  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4044  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.3 
 
 
214 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.73 
 
 
232 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  26.55 
 
 
680 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.37 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.94 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.92 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  38.46 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.81 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  27.56 
 
 
644 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  30.37 
 
 
537 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  44.68 
 
 
637 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  38.18 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  42.55 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2083  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.9 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.152558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.68 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  50 
 
 
167 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  44.68 
 
 
449 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>