86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0840 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 
221 aa  155  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  31.16 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  35.04 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.08 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  31.75 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.88 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.15 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  29.46 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.64 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.63 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  45.45 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  37.31 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.71 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.72 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.45 
 
 
269 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.3 
 
 
209 aa  52  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.1 
 
 
222 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.37 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.61 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  32.99 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.11 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.73 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.55 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.65 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.4 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0287  bacterio-opsin activator  39.62 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0100333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.21 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0022  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.98 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.29 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30 
 
 
282 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.48 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.46 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.68 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  45.45 
 
 
770 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0917  bacterio-opsin activator  27.93 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.93 
 
 
219 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  25.23 
 
 
236 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.57 
 
 
238 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  21.89 
 
 
539 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  49.02 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.17 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 
644 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.51 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.6 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  34.92 
 
 
532 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
991 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.31 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.04 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.66 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0856  HTH DNA binding domain-containing protein  26.02 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  29.82 
 
 
254 aa  45.1  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 
677 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.67 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.55 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.78 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.22 
 
 
336 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.38 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.2 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.35 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  40.43 
 
 
781 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
952 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  26.79 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  23.58 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.14 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  38.33 
 
 
167 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  18.99 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  37.88 
 
 
379 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 
807 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1330  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.33 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  32.08 
 
 
680 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.93 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
1969 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.88 
 
 
211 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 
994 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  46.43 
 
 
834 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.17 
 
 
215 aa  41.6  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.87 
 
 
218 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>