77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2387 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1416  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.56 
 
 		 220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.928147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4963  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.09 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.993638  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1307  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.02 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.05 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.76 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.45 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.05 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.52 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.15 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50.94 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4044  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.33 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2789  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.2 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.23 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.89 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  41.67 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  35 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  41.25 
 
 		 781 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.96 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.7 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  50 
 
 		 564 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1773  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.82 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133955  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  48.21 
 
 		 637 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.29 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.23 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.94 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 		 919 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.15 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0745  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.24 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.94 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.46 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 532 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  32.63 
 
 		 1059 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.87 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.07 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.03 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.04 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1185  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.85 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 1216 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.32 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.51 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.82 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.23 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  32.73 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.23 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.55 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.84 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  29.31 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.66 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.93 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.25 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.62 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.29 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.48 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  31.58 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1971  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.85 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  35.19 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.79 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  42.31 
 
 		 843 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 		 225 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.2 
 
 		 227 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  31.15 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.35 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  29.86 
 
 		 553 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>