103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1556 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 221 aa  443  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  56.73 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33 
 
 		 200 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.07 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.29 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 		 952 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  56.6 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2083  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.58 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.152558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.79 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0022  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.14 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.21 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1167  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.48 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0347926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.87 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3232  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.83 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.13 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1773  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.51 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133955  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.61 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 539 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 		 919 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.61 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.19 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.5 
 
 		 637 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.23 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 		 1059 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.17 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.06 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.78 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.68 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.91 
 
 		 336 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.49 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.44 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.89 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.18 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  40.24 
 
 		 537 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50.98 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.19 
 
 		 282 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.43 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  37.35 
 
 		 1154 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.89 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.26 
 
 		 269 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.78 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  40.68 
 
 		 1216 aa  48.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.12 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.48 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  26.23 
 
 		 666 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.59 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.59 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 		 991 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.96 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2268  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.94 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0657053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  41.38 
 
 		 834 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.63 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.17 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.56 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  40.38 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  41.07 
 
 		 553 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.33 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1971  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.54 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.89 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.29 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.35 
 
 		 712 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.61 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.1 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.47 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  38.98 
 
 		 532 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.89 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.92 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.41 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.98 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.58 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  42.59 
 
 		 781 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.69 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  30.83 
 
 		 644 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.48 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.64 
 
 		 700 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1330  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.24 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  38.46 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.19 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  38.6 
 
 		 680 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.59 
 
 		 564 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.35 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.43 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.18 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 		 843 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.3 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.63 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 		 261 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1609  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.25 
 
 		 243 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.680269  normal  0.358173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.1 
 
 		 209 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.62 
 
 		 235 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.89 
 
 		 210 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>