124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1028 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  79.44 
 
 		 212 aa  347  6e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.7 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  57.41 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.33 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.98 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  58.82 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.65 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.31 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.25 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  51.72 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.54 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.16 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.5 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.91 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  53.57 
 
 		 336 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.03 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  24.43 
 
 		 737 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.23 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  46.43 
 
 		 1059 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  54.9 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 952 aa  52  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.48 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  52.94 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  25.79 
 
 		 728 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  33.67 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2268  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.19 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0657053  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.55 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.35 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.83 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  25.12 
 
 		 539 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50.82 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.14 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.86 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.8 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  52.94 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.38 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.94 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.21 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  53.19 
 
 		 261 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  26.35 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.45 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.38 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.33 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 1216 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  30.87 
 
 		 991 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2083  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.28 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.152558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  27.15 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50.98 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.27 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.44 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.37 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.04 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  27.46 
 
 		 994 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.59 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 666 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  25.48 
 
 		 532 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.23 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  51.06 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.94 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.6 
 
 		 564 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.45 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  28.08 
 
 		 1081 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  37.5 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  42.55 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 		 524 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.56 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.64 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.66 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.29 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.01 
 
 		 267 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3232  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.35 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4963  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.61 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.993638  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.6 
 
 		 637 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  41.07 
 
 		 781 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.63 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  39.29 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.98 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 		 247 aa  45.1  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.91 
 
 		 239 aa  45.1  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.67 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  35.62 
 
 		 1260 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  31.11 
 
 		 449 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.09 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.68 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2789  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.28 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.1 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  31.33 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  31.58 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1336  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.48 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292593  normal  0.783067 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.51 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.76 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>