90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0874 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 
227 aa  464  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.75 
 
 
219 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.35 
 
 
225 aa  134  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.53 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.42 
 
 
220 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.88 
 
 
219 aa  128  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.88 
 
 
222 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2095  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.29 
 
 
282 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.61 
 
 
336 aa  123  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.22 
 
 
219 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.26 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.73 
 
 
219 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.91 
 
 
226 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2148  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.9 
 
 
216 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2268  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.06 
 
 
217 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0657053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.39 
 
 
215 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.11 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.11 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.38 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.6 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.49 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.05 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.62 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.52 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.38 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.91 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.79 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.5 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  26.85 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.1 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.71 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.36 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4849  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.36 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0189748  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.94 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0022  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.91 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.64 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1041  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.87 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.7 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.43 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.8 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.23 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.71 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.29 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3266  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.26 
 
 
223 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255434  normal  0.0894287 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3112  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  49.02 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.49 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.85 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.43 
 
 
200 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.36 
 
 
209 aa  48.5  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.18 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.83 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.97 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.98 
 
 
218 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.21 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.05 
 
 
247 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.56 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.94 
 
 
245 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 
243 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.66 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  35.85 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3736  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.67 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.72 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.33 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.69 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.14 
 
 
217 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.35 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.86 
 
 
728 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  32.67 
 
 
781 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1467  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.74 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.69 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1336  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.81 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292593  normal  0.783067 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.44 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2083  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.62 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.152558 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  36.21 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.8 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.29 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  38.89 
 
 
192 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.75 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.43 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.93 
 
 
198 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  33.82 
 
 
224 aa  42  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  36.84 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 
223 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.2 
 
 
229 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.77 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>