49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1221 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1221  bacterio-opsin activator  100 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  29.95 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  30.26 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.8 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0992  bacterio-opsin activator  28.48 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000881658  hitchhiker  0.00988265 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  33.56 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0032  bacterio-opsin activator  25.11 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.48 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.33 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.57 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.89 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  31.62 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0917  bacterio-opsin activator  33.61 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.31 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4716  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.78 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  25.81 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.67 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.64 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.68 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  31.68 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.35 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4199  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.48 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.275628  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.83 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.85 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.97 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.31 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0779  bacterio-opsin activator  36.36 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.64 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.07 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.05 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.67 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.78 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1338  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.26 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0745  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.73 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  35.21 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  41.51 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.93 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1452  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.47 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.43 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.51 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  28.3 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.85 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1428  bacterio-opsin activator  28.12 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0374788 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.51 
 
 		 216 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1155  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.33 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.376483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>