174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1345 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1345  HPr kinase  100 
 
 		 473 aa  947    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2772  AAA ATPase  43.89 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  41.39 
 
 		 827 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  37.78 
 
 		 834 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  32.98 
 
 		 783 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.57 
 
 		 792 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.93 
 
 		 1108 aa  140  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.91 
 
 		 1014 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.03 
 
 		 919 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.61 
 
 		 992 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.46 
 
 		 934 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.9 
 
 		 1027 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 1022 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.79 
 
 		 981 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.62 
 
 		 1030 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.15 
 
 		 931 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 1071 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  33.24 
 
 		 632 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 1022 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.68 
 
 		 941 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.68 
 
 		 1034 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  35.35 
 
 		 928 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  35.53 
 
 		 1025 aa  120  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 		 965 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 913 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.63 
 
 		 1003 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 995 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.78 
 
 		 1010 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 612 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.34 
 
 		 992 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 1033 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 		 996 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  35.13 
 
 		 1138 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 1008 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 990 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.9 
 
 		 915 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.65 
 
 		 990 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 1011 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.26 
 
 		 775 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.86 
 
 		 908 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.88 
 
 		 788 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  34.04 
 
 		 838 aa  113  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.74 
 
 		 1017 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  31.1 
 
 		 1025 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.82 
 
 		 921 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  31.54 
 
 		 993 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 1001 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 654 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 		 964 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.78 
 
 		 1088 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 775 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 930 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  35.65 
 
 		 921 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 935 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 		 1024 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  31.83 
 
 		 806 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 982 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  34.28 
 
 		 761 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  34.69 
 
 		 715 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  35.46 
 
 		 1004 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 1048 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 		 814 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  31.56 
 
 		 1020 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 1319 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.51 
 
 		 1054 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 850 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.77 
 
 		 946 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 965 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  28.76 
 
 		 1030 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.34 
 
 		 993 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  33.53 
 
 		 1003 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 		 962 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.28 
 
 		 621 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.06 
 
 		 983 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 940 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  34.53 
 
 		 666 aa  96.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  31.71 
 
 		 797 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  32.39 
 
 		 978 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  30.86 
 
 		 956 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.79 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 755 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 1003 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 907 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 621 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  30.77 
 
 		 790 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 937 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  32.51 
 
 		 757 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  33.54 
 
 		 989 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33.86 
 
 		 970 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  34.01 
 
 		 862 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  29.69 
 
 		 907 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 1346 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  29.76 
 
 		 928 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  31.38 
 
 		 770 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 687 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 		 810 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 978 aa  87  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 926 aa  86.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 981 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  29.6 
 
 		 690 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>