203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2772 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2772  AAA ATPase  100 
 
 
466 aa  931    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1345  HPr kinase  43.89 
 
 
473 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  32.05 
 
 
834 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  33.93 
 
 
827 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  36.74 
 
 
996 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.28 
 
 
783 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.12 
 
 
964 aa  133  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  29.28 
 
 
792 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.51 
 
 
1071 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 
1030 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  29.33 
 
 
934 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  31.34 
 
 
993 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  30.31 
 
 
981 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  28.53 
 
 
913 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.3 
 
 
1108 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  30.68 
 
 
1008 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.28 
 
 
965 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 
1017 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  31.12 
 
 
931 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 
806 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.55 
 
 
941 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  29.7 
 
 
928 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 
1027 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  31.1 
 
 
990 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  30.57 
 
 
1138 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  29.91 
 
 
907 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 
782 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  29.53 
 
 
992 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  30.63 
 
 
1033 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 
1001 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  30.22 
 
 
790 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 
1022 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.79 
 
 
992 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 
962 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.43 
 
 
788 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.54 
 
 
1048 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  30.4 
 
 
797 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.33 
 
 
982 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  28.06 
 
 
1022 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  30.54 
 
 
838 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 
908 aa  100  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
850 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  31.72 
 
 
1014 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  33.23 
 
 
770 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  29.79 
 
 
775 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  30.09 
 
 
993 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.84 
 
 
915 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  28.49 
 
 
935 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  29.15 
 
 
1003 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.42 
 
 
940 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  28.96 
 
 
930 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  33.43 
 
 
1319 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  31.29 
 
 
757 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  30.57 
 
 
621 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  29.3 
 
 
990 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  27.59 
 
 
1025 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 
1003 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.96 
 
 
1011 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  27.72 
 
 
995 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  29.09 
 
 
632 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  29.11 
 
 
983 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  30.06 
 
 
919 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  30.49 
 
 
978 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  32.15 
 
 
814 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  35.06 
 
 
862 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  29.69 
 
 
1030 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  29.19 
 
 
1003 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  28.39 
 
 
1010 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  29.01 
 
 
1088 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  27.94 
 
 
1034 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  29.84 
 
 
937 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  29.18 
 
 
921 aa  86.7  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 
965 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  28.19 
 
 
981 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  28.37 
 
 
970 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  30.21 
 
 
921 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  33.48 
 
 
994 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 
775 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  29.4 
 
 
462 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  28.44 
 
 
1024 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 
612 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  28.45 
 
 
690 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  28.61 
 
 
654 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 
742 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  27.59 
 
 
741 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  27.61 
 
 
715 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 
1025 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  26.72 
 
 
956 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  28.06 
 
 
967 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  29.06 
 
 
989 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  28.77 
 
 
963 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  31.18 
 
 
941 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  29.34 
 
 
1346 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  28.11 
 
 
946 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 
792 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  30.89 
 
 
761 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  29.92 
 
 
810 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
907 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  28.36 
 
 
1060 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  27.17 
 
 
1020 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>