More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2792 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  100 
 
 		 345 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  66.28 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  66.86 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  66.09 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  59.53 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  58.06 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  57.77 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  51.91 
 
 		 349 aa  328  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  48.52 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  39.47 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  40.29 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  38.12 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  38.42 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  39.65 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  40.64 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  38.37 
 
 		 356 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  36.93 
 
 		 339 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  33.7 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  31.53 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  33.81 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  33.56 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  37.06 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  33.15 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  32.56 
 
 		 339 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  35.6 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  33.52 
 
 		 350 aa  129  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  35.48 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  35.48 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  35.28 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  34.13 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  31.49 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  34.84 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  33.53 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  32.31 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  31.5 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  31.41 
 
 		 357 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  34.12 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  30.37 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  30.92 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  31.55 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  35.11 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  29.66 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  28.08 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  26.15 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  27.4 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  28.92 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  27.97 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.35 
 
 		 349 aa  85.9  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  24 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.02 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.02 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  25.16 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  25.78 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  34.11 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  24.7 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.64 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  31.84 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  24.72 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.1 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  24.31 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  34.58 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  31.65 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.44 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  46.15 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0778  LacI family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.602381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.76 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  30.43 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  29.68 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  29.95 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  27.57 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  29.78 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  27.37 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2627  LacI family transcription regulator  32.95 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  27.57 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  33.09 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.41 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  32.79 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.48 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  25.42 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  25.54 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  45.33 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>