More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3990 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 349 aa  697    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  55.49 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 340 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  49.27 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  49.85 
 
 		 345 aa  295  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  48.52 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  47.21 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  49.27 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  47.21 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  44.9 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  40.88 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  41.18 
 
 		 351 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  40.52 
 
 		 351 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  38.42 
 
 		 345 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  35.99 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  39.94 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  36.58 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  37.83 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  37.94 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  31.96 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  35.75 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  34.2 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  30.14 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  34.2 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  34.97 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  32.56 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  33.76 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  34 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  33.79 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 345 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  30.38 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  34.38 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  31.7 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  31.05 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  26.09 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  32.61 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  32.11 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  31.4 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  30.72 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  25.43 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  31.78 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  30.77 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.38 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.32 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.28 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  23.78 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.7 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  23.48 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  24.13 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  24.32 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.89 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  22.19 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.07 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  23.24 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.73 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  36.63 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  25.87 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0778  LacI family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.602381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  32.58 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  23.38 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.42 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2029  HTH-type transcriptional repressor  34.88 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.169196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  34.17 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.42 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  33.17 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1526  transcriptional regulator, LacI family  31.41 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.114079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  25.3 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  43.48 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1270  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.27 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.127436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  23.67 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  25.38 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  21.83 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  24.89 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>