More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0549 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 343 aa  681    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  97.96 
 
 		 340 aa  662    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  86.01 
 
 		 343 aa  595  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  59.36 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  59.36 
 
 		 340 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  60.41 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  59.53 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  48.52 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  44.38 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  35.99 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  35.21 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  37.46 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  35.76 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  36.26 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 357 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  30.14 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  34.6 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  32.57 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  30.64 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  29.89 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 347 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  31.04 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  30.62 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  30.32 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  29.29 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  32.15 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  32.6 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  30.03 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  29.26 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  30.65 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  33.76 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  29.18 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  25.71 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  34.72 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  28.32 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  29.1 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  29.32 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  29.1 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 357 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  27.39 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  24.35 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  27.74 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0778  LacI family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.602381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1526  transcriptional regulator, LacI family  32.3 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.114079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21140  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.17 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  26.09 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.31 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  23.71 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  27.63 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  29.81 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  27.56 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.09 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  29.34 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  30.62 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  26.15 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  26.86 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  31.6 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  26.53 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  31.48 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25.85 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  26.75 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  25 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  26.15 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  34.38 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  25.85 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  29.74 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  25.76 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  25.24 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  43.42 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4322  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  43.75 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  28.57 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0911  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  43.75 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  25.7 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25.54 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>