More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2712 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 342 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  55.49 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  44.67 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  44.97 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  48.52 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  46.75 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  44.38 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  43.49 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  42.51 
 
 		 351 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  40.6 
 
 		 351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  39.7 
 
 		 351 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  46.75 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  42.65 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  42.86 
 
 		 345 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  38.12 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  39.93 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  38.28 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 357 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  33.33 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  36.02 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  35.16 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  33.24 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  33.86 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  27.68 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  35.56 
 
 		 377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  35.42 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  33.97 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  29.86 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  31.59 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  33.65 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  33.65 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  33.01 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  32.91 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  27.35 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  30.81 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  30.1 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  28.96 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  29.6 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 		 347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  27.89 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  29.8 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  30.52 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  30.81 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  29.61 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.67 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  29.07 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  30.92 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  34.41 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  24.34 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  31.76 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  24.71 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.62 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.62 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.47 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  25 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.22 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.11 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.63 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1601  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.3 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  23.7 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.19 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  21.7 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1890  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.6 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.31 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.64 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  24.18 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  23.53 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.47 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2717  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  25 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0686  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.85 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3345  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.32 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  44.74 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  26.83 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  27.85 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1270  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.91 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.127436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6639  transcriptional regulator, LacI family  26.36 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1273  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  27.68 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0973  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.34 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000623082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.32 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0413  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.5 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000162891  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5473  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.89 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433436  normal  0.94425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.32 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  26.46 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3001  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.03 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>