More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1050 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 346 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  51.93 
 
 		 333 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  50.45 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  37.46 
 
 		 330 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  35.34 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 354 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 354 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 354 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  34.32 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 354 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  32.42 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  30.48 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  31.7 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  30.32 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  31.18 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  29.62 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  32.51 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  31.03 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  31.39 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  29.68 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  27.85 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  29.03 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  30.63 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  29.15 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  26.59 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  29.38 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  30 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  28.99 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  30.06 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  26.65 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  29.81 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  29.87 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  25.28 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.85 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  26.71 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1880  LacI family transcription regulator  32.72 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.23 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.23 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  28.1 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  24.71 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.52 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.18 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  24.44 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2199  LacI family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.585531 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0595  LacI family transcription regulator  24.04 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000015362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  22.08 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  29.21 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  24.53 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.15 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.98 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  22.4 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  27.17 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3199  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.13351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  27.17 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  27.57 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  27.54 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  27.17 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  27.17 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  27.17 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2332  transcriptional regulator, LacI family  28.64 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0311  LacI family transcription regulator  28.63 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0767  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.58 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000173406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  26.07 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.71 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  23.25 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.78 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  27.52 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  29.1 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  27.52 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  24.62 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  27.52 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>