210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  100 
 
 		 340 aa  697    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  47.16 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  45.83 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  45.07 
 
 		 336 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  43.79 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  43.88 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  46.02 
 
 		 342 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  42.64 
 
 		 366 aa  242  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  43.2 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  40.41 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  39.82 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  32.95 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  31.82 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  31.92 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  30.49 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  33.76 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 343 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  30.18 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  30.98 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  28.26 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  30.62 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  30.23 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  30.29 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  29.6 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  29.81 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  31.49 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  26.55 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  32.09 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  28.2 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  26.99 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  29.79 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  26.55 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  28.08 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  28.65 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  27.36 
 
 		 334 aa  99  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  26.59 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  28.01 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  28.57 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  26.54 
 
 		 377 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  26.56 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  28.96 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  28.23 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  28.13 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  22.07 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  24.76 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  27.64 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  24.15 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  25.09 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  23.96 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  25.96 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  21.38 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  27.38 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  23.84 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  23.78 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.7 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.31 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.06 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  22.74 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.29 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  24.39 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  27.91 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.45 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  21.03 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  24.62 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0617  transcriptional regulator, LacI family  28.73 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3422  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.78 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  21.49 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3687  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.743219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4006  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.36 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03519  putative transcriptional regulator  22.28 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03470  hypothetical protein  22.28 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  23.16 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1329  transcriptional regulator, LacI family  27.48 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  25 
 
 		 384 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  25.89 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1669  HTH-type transcriptional regulator GalR  25.89 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  25.89 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  22.59 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  26.74 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  28.64 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1480  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.29 
 
 		 312 aa  49.3  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6155  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (periplasmic binding protein)  23.56 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.83 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>