More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4043 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 373 aa  766    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  79.54 
 
 		 348 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  68.02 
 
 		 368 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  44.96 
 
 		 350 aa  271  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  41.33 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 		 342 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  43.45 
 
 		 350 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  38.95 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  43.44 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  38.66 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  40.84 
 
 		 334 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 		 336 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  37.34 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  32.56 
 
 		 351 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  33.99 
 
 		 351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  30.17 
 
 		 335 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  30.87 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  30.35 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  28.26 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  33.88 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  33.66 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  30.52 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  30.35 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  31.17 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  29.49 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  26.55 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  29.32 
 
 		 343 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  28.85 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  33.99 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  30.82 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  28.48 
 
 		 333 aa  97.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  29.02 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 343 aa  96.3  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  23.15 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  30.92 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  27.75 
 
 		 363 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  27.63 
 
 		 357 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  27.17 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  26.57 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  26.71 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  26.88 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  26.88 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  26.88 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  26.65 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  22.77 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  22.9 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  23.93 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  26.78 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  31.05 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  21.66 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  24.31 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  20.85 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  25.47 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  25.35 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  25.19 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3422  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  31.25 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3687  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  24.67 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.743219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  25.31 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.23 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.23 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  25.73 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  21.89 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  27.55 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  22.06 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3102  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.3 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  22.18 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.72 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.39 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  26.36 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  23.53 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  24.03 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  26.08 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  23.18 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  24.4 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  27.14 
 
 		 342 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  22.66 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  21.89 
 
 		 332 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  21.46 
 
 		 332 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  21.89 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  21.89 
 
 		 332 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  21.89 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  21.89 
 
 		 332 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 336 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  25.81 
 
 		 343 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0519  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  25.81 
 
 		 340 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>