132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1852 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  100 
 
 		 337 aa  673    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  49.4 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  51.47 
 
 		 347 aa  299  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  49.55 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  50.6 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  46.99 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  43.2 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  47.31 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  45.67 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  43.73 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  40.36 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  33 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  33.23 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  30.81 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  29.2 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  32.09 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  30.93 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  30.56 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  28.61 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  29.63 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  30.19 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  30 
 
 		 335 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  25.6 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  31.17 
 
 		 363 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  30.04 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  30.2 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  26.47 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  30.88 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  27.58 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  29.59 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  29.32 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  29.32 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  24.23 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  28.67 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  26.61 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  29.05 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  32.73 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  28.94 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  22.88 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  24.42 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  27.44 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  30.6 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  25.89 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  21.4 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  29.23 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.93 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.4 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  22.51 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.1 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.1 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  27.36 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  21.04 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.38 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  29.02 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  20.26 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.07 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.84 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  23.28 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  24.72 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3687  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  24.48 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.743219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.27 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  20.8 
 
 		 354 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3422  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.48 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  24.73 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.73 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  26.86 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  26.64 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  26.64 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  26.5 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  22.07 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  27.56 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.55 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  33.61 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  30.82 
 
 		 357 aa  46.2  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  25.22 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.66 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0008  D-ribose transporter subunit RbsB  24.34 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0517  D-ribose transporter subunit RbsB  24.14 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>