More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2766 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 336 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  42.4 
 
 		 342 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  42.4 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  44.87 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  41.18 
 
 		 343 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  42.11 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  40.32 
 
 		 342 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  39.02 
 
 		 348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  38.76 
 
 		 379 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  37.42 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  34.3 
 
 		 357 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 351 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  34.55 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  32.04 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  32.11 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  34.75 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  34.67 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  32.78 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  30.95 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  29.13 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  29.61 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  30.87 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  30.56 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  29.84 
 
 		 354 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  29.84 
 
 		 354 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  30.16 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  29.47 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  25.63 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  29.24 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  38.31 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  29.24 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  26.39 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  29.1 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  32.17 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  30.19 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  30.91 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  28.13 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  25.09 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  23.27 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  27.21 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  24.35 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1131  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  22.19 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  24.51 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  22.95 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  29.73 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  41.56 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  33.57 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.08 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  46.67 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  29.26 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2199  LacI family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.585531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3173  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0802  alanine racemase  29.74 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1780  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13850  transcriptional regulator, LacI family  39.51 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  26.85 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.36 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  30.63 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2163  transcriptional regulator, LacI family  28.04 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1882  LacI family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.711539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  30.98 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  35.48 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  28.93 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3351  LacI family transcription regulator  27.5 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  decreased coverage  0.0034898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  32.08 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  38.96 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  27.44 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5857  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.55822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  33.08 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0746  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  39.19 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.24 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  24.79 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  37.37 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1562  DNA-binding transcriptional regulator GalS  42.47 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.4 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2332  transcriptional regulator, LacI family  39.53 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>