211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4170 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 368 aa  759    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  68.02 
 
 		 373 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  69.12 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  42.55 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  38.89 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  39.17 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 342 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  37.64 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  41.81 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 		 336 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  39.03 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  30.52 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  32.97 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  29.3 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 351 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  29.57 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  29.63 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  28.09 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  28.76 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  29.64 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 343 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  30.42 
 
 		 343 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 342 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  30.26 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 333 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  29.92 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  27.48 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  27.2 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  24.76 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  28.17 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  27.8 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  27.41 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  28.62 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  26.57 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  26.09 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  24.67 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  29.57 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  22.46 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  26.92 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  25.68 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  24.62 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  23.9 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  24.16 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  25.09 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  25.09 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  25.09 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  22.69 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  27.27 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  28.3 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  23.05 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  25.17 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  23.61 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0673  regulatory protein, LacI  26.57 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.371597  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  23.11 
 
 		 357 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  23.4 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  28.29 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  24.82 
 
 		 339 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  22.13 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  26.04 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  25.81 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  31.98 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 340 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.24 
 
 		 323 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  28.67 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3423  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  42.86 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3225  hypothetical protein  29.55 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.34 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3927  LacI family transcription regulator  28.39 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3278  DNA-binding transcriptional regulator GalR  25.23 
 
 		 338 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.34 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  26.2 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  30.05 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  26 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.21 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  33.08 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  36.14 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  35.23 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5143  transcriptional regulator LacI family  27.1 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  42.86 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.34 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0425  transcriptional regulator, LacI family  42.47 
 
 		 328 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4284  LacI family transcription regulator  42.47 
 
 		 328 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0600  transcriptional regulator, LacI family  38.26 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0778  LacI family transcription regulator  34.43 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.551884  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.33 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0519  LacI family transcription regulator  40.54 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2404  transcriptional regulator, LacI family  50.98 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000976758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  21.66 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0072  transcriptional regulator LacI family  33.12 
 
 		 343 aa  46.2  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>