More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1455 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  100 
 
 		 356 aa  700    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  45.4 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  42.99 
 
 		 345 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  41.42 
 
 		 351 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  41.42 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  37.97 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  38.99 
 
 		 351 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  39.13 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  38.12 
 
 		 342 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  37.09 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  37.13 
 
 		 345 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  36.26 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  38.6 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  35.99 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  35.09 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  37.09 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  34.23 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  34.77 
 
 		 377 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  31.87 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  35.09 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  34.06 
 
 		 363 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  31.72 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  34.06 
 
 		 354 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  34.06 
 
 		 354 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  33 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  30.52 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  31.42 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  32.6 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  30.87 
 
 		 373 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  28.26 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 368 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  34.75 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  30.77 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  25.94 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  30.35 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 342 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  28.82 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  30.1 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 357 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  30.91 
 
 		 337 aa  96.7  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  28.71 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7477  sugar ABC transporter  29.47 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  21.99 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.68 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.71 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  22.25 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.34 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.34 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  22.66 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  27.8 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.35 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.04 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51630  periplasmic sugar-binding protein  29.1 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.9 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  32.2 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.26 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  28.77 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  23.92 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02611  hypothetical protein  24.86 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  28.5 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  22.32 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02650  D-ribose-binding periplasmic protein  24.86 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.01 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  31.87 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.88 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  23.68 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  31.32 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0454  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.79 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  25.36 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1252  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.29 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.81 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6472  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.29 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6707  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.29 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2634  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6313  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.29 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.85 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0150  LacI family transcription regulator  30.59 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>