More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0444 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 368 aa  751    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  59.71 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  27.22 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  29.27 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  30.36 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  26.99 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  29.07 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  26.36 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.71 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  28.71 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  24.71 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  28.8 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  24.29 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  27.63 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  26.29 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  27.5 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.86 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  26.42 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  25.93 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.2 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  23.56 
 
 		 352 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.38 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.38 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1259  alanine racemase  23.34 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.64 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  25.59 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  26.39 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.48 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  26.73 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  25 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  22.67 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7364  ABC transporter substrate binding protein  27.07 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  25.61 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0185  alanine racemase  30.96 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  25.9 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  25.9 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.67 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  26.1 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.86 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.05 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  24.09 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  26.05 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.83 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0026  regulatory protein LacI  42.17 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0782  regulatory protein, LacI  28.05 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  24.8 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2594  putative periplasmic binding ABC transporter protein  23.97 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.693301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.93 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  33.99 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0550  LacI family transcription regulator  26.34 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0273  RbsB protein  25.61 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  29.47 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1526  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.114079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  34.36 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2119  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  22.64 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.8 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.3 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  40.3 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  24.79 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  26.89 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  28.94 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.94 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  28.94 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5473  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.89 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433436  normal  0.94425 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  23 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5133  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  26.77 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  28.94 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.94 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.94 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.94 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  25.22 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.94 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0784  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  32.23 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.515938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  25.45 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1112  LacI family transcription regulator  29.17 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0361448  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.87 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  23.23 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.68 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  27.38 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.83 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  27.67 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.28 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0293175  normal  0.309769 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6472  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6707  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2634  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.2 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>