More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0782 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0782  regulatory protein, LacI  100 
 
 
327 aa  663    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1587  regulatory protein LacI  55.66 
 
 
333 aa  385  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000010083  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0580  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 
330 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0778  LacI family transcriptional regulator  36.83 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.602381  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1526  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.114079  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1261  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 
331 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  35.17 
 
 
355 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3225  hypothetical protein  33.74 
 
 
335 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118806  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3423  extracellular solute-binding protein family 1  33.74 
 
 
335 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2920  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.95 
 
 
318 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 
336 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 
347 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.25 
 
 
336 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.4 
 
 
339 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.46 
 
 
348 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  28.83 
 
 
333 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  28.83 
 
 
334 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 
335 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.68 
 
 
341 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 
351 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  28.83 
 
 
333 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  28.83 
 
 
333 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  28.83 
 
 
333 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  28.83 
 
 
333 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  31.31 
 
 
323 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.08 
 
 
333 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  31.31 
 
 
323 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  31.31 
 
 
323 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  31.31 
 
 
323 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  31.31 
 
 
323 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  31.31 
 
 
323 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 
327 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  28.27 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  31.31 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  29.45 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  31 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.61 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.54 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  28.57 
 
 
334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.88 
 
 
335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 
330 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 
335 aa  119  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  31 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.98 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  28 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  30.7 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.09 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  28.17 
 
 
337 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 
359 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 
334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  26.59 
 
 
353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 
333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.44 
 
 
368 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.86 
 
 
339 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 
341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2465  HTH-type transcriptional regulator, LacI-family  27.67 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.06 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.91 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  26.75 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.06 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  29.76 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  28.06 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  28.75 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  26.77 
 
 
347 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  25.36 
 
 
345 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 
346 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  28.71 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  26.92 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 
343 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  29.64 
 
 
333 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  26.87 
 
 
339 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 
343 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  27.17 
 
 
342 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.59 
 
 
334 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  27 
 
 
343 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  27 
 
 
343 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  27 
 
 
343 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  27 
 
 
343 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.29 
 
 
347 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  25.9 
 
 
363 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  26.97 
 
 
331 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4341  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 
325 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  29.47 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.53 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28.9 
 
 
346 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  27.57 
 
 
339 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 
338 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.53 
 
 
351 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  26.82 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.49 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.07 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>