More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1826 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  100 
 
 
329 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  100 
 
 
329 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  84.5 
 
 
329 aa  581  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  55.72 
 
 
332 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  55.72 
 
 
332 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  55.72 
 
 
332 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  55.89 
 
 
331 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  55.72 
 
 
332 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  55.42 
 
 
332 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  55.72 
 
 
332 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  55.72 
 
 
332 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  55.42 
 
 
332 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  55.42 
 
 
332 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  55.42 
 
 
332 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  55.89 
 
 
330 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  55.42 
 
 
332 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0436  catabolite control protein A  46.22 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000109706  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0707  RegM family transcriptional regulator  48.48 
 
 
334 aa  297  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000462743  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  46.95 
 
 
331 aa  291  9e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0550  LacI family transcription regulator  47.29 
 
 
336 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  45.59 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0679  catabolite control protein  45.9 
 
 
333 aa  281  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.641859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0684  LacI family transcription regulator  42.86 
 
 
328 aa  258  8e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0236047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  40.73 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  40.66 
 
 
332 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  40.66 
 
 
332 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.46 
 
 
337 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.23 
 
 
336 aa  209  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.22 
 
 
339 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 
332 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 
333 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.94 
 
 
330 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 
346 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.62 
 
 
386 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0881  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 
336 aa  182  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00312464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 
337 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.98 
 
 
329 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 
335 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 
335 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.84 
 
 
347 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.12 
 
 
341 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  31.6 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  34.55 
 
 
323 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  35.15 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  35.15 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  35.15 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  34.85 
 
 
323 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  32.11 
 
 
349 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  34.55 
 
 
323 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 
340 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  34.85 
 
 
323 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  34.85 
 
 
323 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  34.85 
 
 
323 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  34.55 
 
 
323 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  31.72 
 
 
337 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.31 
 
 
337 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3688  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 
332 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.75 
 
 
342 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.39 
 
 
347 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 
359 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.14 
 
 
323 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.39 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  28.96 
 
 
323 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  32.72 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  31.99 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.89 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  33.66 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  32.32 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  32.42 
 
 
333 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  32.42 
 
 
333 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  32.42 
 
 
333 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 
332 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  32.42 
 
 
333 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.35 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  28.35 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.35 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.35 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.35 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.35 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.35 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  33.55 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  28.35 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.31 
 
 
332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.11 
 
 
342 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
355 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 
327 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.5 
 
 
342 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 
342 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.31 
 
 
330 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  28.13 
 
 
338 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  31.48 
 
 
339 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 
341 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  30.42 
 
 
332 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 
333 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>