More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0157 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 344 aa  688    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  26.8 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  25.43 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  25.58 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  25.38 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  24.29 
 
 		 368 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  27.51 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  24.34 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  23.41 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  23.71 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  23.56 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  26.35 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  23.75 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  25 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1870  transcriptional regulator, LacI family  25.2 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  29.81 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  24.35 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  24.58 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  24.93 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  23.93 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  23.89 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  46.91 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  24.51 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  24.43 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  24.15 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  23.8 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  23.76 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.99 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  21.99 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  24.03 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28330  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  23.49 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  24.71 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  32.12 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.28 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  24.93 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  25.36 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  24.04 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  24.44 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0881  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00312464  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  22.9 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.24 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  22.79 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  22.54 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  27.61 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  42.17 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  27.16 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  22.22 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  41.07 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.37 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.02 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  25.28 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  28.49 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  22.61 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.42 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  24.41 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  27.67 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.09 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0550  LacI family transcription regulator  27.68 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  20.71 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  41.98 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  22.9 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1382  LacI family transcription regulator  24.38 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.641116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  35.58 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  24.32 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1342  LacI family transcription regulator  24.38 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  24.85 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  31.82 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  26.2 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 371 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  25.78 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  36.14 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1273  transcriptional regulator, LacI family  24.79 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7004  transcriptional regulator, LacI family  23.1 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.93 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  25.68 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4325  LacI family transcription regulator  23.68 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  40.96 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  38.55 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  29.28 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.98 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  29.28 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0590  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000145078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  29.28 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  21.79 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7624  LacI family transcription regulator  27.05 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2710  regulatory protein, LacI  30.94 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  27.07 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  27.24 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  40.48 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  21.83 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  40.48 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  21.58 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  21.83 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>